我發(fā)布腦膠質(zhì)瘤組學(xué)數(shù)據(jù) 將向全球免費(fèi)開(kāi)放
科技日?qǐng)?bào)北京7月8日電 (實(shí)習(xí)記者于紫月)8日,記者從首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京天壇醫(yī)院了解到,中國(guó)腦膠質(zhì)瘤基因組圖譜計(jì)劃(CGGA)數(shù)據(jù)庫(kù)近日發(fā)布2000例中國(guó)腦膠質(zhì)瘤樣本的功能基因組學(xué)數(shù)據(jù)。經(jīng)過(guò)15年的臨床標(biāo)本和組學(xué)數(shù)據(jù)積累,目前該數(shù)據(jù)庫(kù)日臻完善,全部基因組數(shù)據(jù)向全世界研究者免費(fèi)開(kāi)放。據(jù)不完全統(tǒng)計(jì),已有美國(guó)、歐洲多家知名研究機(jī)構(gòu)近200篇SCI論文引用該數(shù)據(jù)庫(kù)。
CGGA發(fā)起人和創(chuàng)建者、北京天壇醫(yī)院神經(jīng)外科副主任江濤介紹,此次公布的數(shù)據(jù)涉及不同組織病理分類、不同WHO惡性度分級(jí)、原發(fā)/復(fù)發(fā)配對(duì)樣本,還包含了詳盡的臨床數(shù)據(jù),包括患者性別、年齡、放療和化療情況、完整隨訪數(shù)據(jù)等。針對(duì)不同組學(xué)數(shù)據(jù)特點(diǎn),研究團(tuán)隊(duì)還開(kāi)發(fā)了不同的在線分析工具,包括腦膠質(zhì)瘤突變圖譜繪制、基因表達(dá)及其DNA甲基化的分布模式展示、相關(guān)性分析以及生存分析結(jié)果可視化等。
腦膠質(zhì)瘤是成人最常見(jiàn)的顱內(nèi)原發(fā)惡性腫瘤。2004年起,江濤團(tuán)隊(duì)開(kāi)始致力于中國(guó)腦膠質(zhì)瘤生物樣本庫(kù)的建立及臨床隨訪數(shù)據(jù)的收集。在神經(jīng)外科專家王忠誠(chéng)院士的指導(dǎo)下,CGGA于2012年啟動(dòng)。依托于國(guó)家神經(jīng)系統(tǒng)疾病臨床醫(yī)學(xué)研究中心、北京市神經(jīng)外科研究所以及北京天壇醫(yī)院,目前CGGA數(shù)據(jù)庫(kù)已經(jīng)成為亞洲乃至全世界最大規(guī)模的腦膠質(zhì)瘤醫(yī)學(xué)信息工程。
“我們希望通過(guò)基因組學(xué)技術(shù)分析,全面繪制中國(guó)人群的腦膠質(zhì)瘤基因組圖譜,讓國(guó)內(nèi)外更多從事腦膠質(zhì)瘤的研究者可以對(duì)數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行挖掘利用。”江濤表示,CGGA數(shù)據(jù)庫(kù)有助于推動(dòng)腦膠質(zhì)瘤新型診療模式的發(fā)展,讓更多腦膠質(zhì)瘤患者獲益。